15 років тому ми секвенували людський геном, тепер можемо мапувати його

Вікіпедія

Команда дослідників розробила спосіб створення тривимірного зображення дорожньої карти для людської біології - геному людини.

НАСТУПНИЙ КРОК. У 2003 році дослідники вперше секвенували людський геном, виписавши всі 3 мільярди пар основ ДНК, які диктують кожен аспект нашого макіяжу. Тепер нова команда дослідників розробила спосіб створення тривимірного зображення цінного дорожньої карти для людської біології.

Вони опублікували свої дослідження у вівторок в Journal of Cell Biology.

КРАЩА КАРТА. Після того, як ми секвенували людський геном, у нас був (дуже) довгий список листів. Ми знали про подвійної спіралі і що кожна людська клітина містила всю цю послідовність ДНК в більш-менш визначеному порядку, але ми не знали багато про тривимірному розташуванні пар ДНК - тобто, де різні пари в подвійної спіралі були розташовані в залежності від ядерних структур клітини . Це важливо, тому що це може розповісти нам багато про свою функції і діяльності.

Ось тут вступає в гру нове дослідження з Університету Іллінойсу в Урбана-Шампейн.

Ці дослідники розробили метод картографування, який вони називають секвенуванням посилення тірамідного сигналу (TSA-Seq). Тірамід - це молекула, яка, будучи випущеною зі спеціального ферменту, який міститься навколо певних ядерних структур, поміщає будь-яку ДНК, в якій вона знаходиться. Чим ближче ген до цих конкретних структурам, тим сильніше сигнал від тірамідной етикетки - так само, як ваш одяг стає більш вологою, якщо ви стоїте ближче до спринклерів.

РОЗТАШУВАННЯ, РОЗТАШУВАННЯ, РОЗТАШУВАННЯ. Дослідники протестували TSA-Seq в клітинах лейкемії в лабораторії (не турбуйтеся, клітини не були живі). Вони з'ясували, що гени, ближчі до одного виду ядерної структури (ядерні плями), часто активніші, ніж ті, які ближче до іншої (ядерна пластинка).

Ми дійсно не знаємо, що роблять ядерні плями, але ми можемо бути краще підготовлені до того, щоб зрозуміти це зараз, коли знаємо, що вони, схоже, грають якусь роль в генетичній активності.

«Логіка цієї ядерної організації ще належить визначити, але наша модель передбачає, що хромосомні руху всього на кілька сотень нанометрів можуть мати істотне функціональне значення», - сказав дослідник в прес-релізі Ендрю Белмонт.

В даний час команда планує продовжити розробку техніки TSA-Seq. Зрештою, дослідники сподіваються відобразити тривимірні положення генів в інших типах клітин, зосередившись на тому, як позиції можуть змінюватися в міру того, як клітини старіють або стають хворими. Чим більше ми дізнаємося про структуру геному людини, тим краще ми будемо в кінцевому підсумку писати власний геном.

Джерела: EurekAlert