Потужний новий метод клонування може клонувати тисячі генів відразу
Клонування ЛАССО
Учені з Гарвардської медичної школи, Джонс Хопкінс, Рутгерс і Університету Тренто в Італії розробили клонування LASSO - нову молекулярну техніку. Клонування LASSO можна використовувати для одночасного виділення довгих послідовностей ДНК швидше, ніж це було можливо раніше. Цей новий метод прискорює створення білка, а це означає, що гени (кінцевий продукт процесу) досягаються швидше. Це, в свою чергу, може забезпечити набагато більш швидке виявлення біомаркерів для численних захворювань і їх лікування.
В минулому дослідники з'ясовували, що робить ген, клонуючи свою ДНК, а потім висловлюючи білок, який він кодує, - єдиний ген одним геном. При цьому новому молекулярному підході одна реакція може клонувати і висловлювати тисячі послідовностей ДНК відразу. Ця методика включає використання нової захопленої ДНК-ланцюги, зонд LASSO (довголанцюжкових одношаровий олигонуклеотид). Дослідники можуть використовувати колекції цих інструментів для «захоплення» послідовностей ДНК, які вони після. Однак, на відміну від великої рогатої худоби ковбоя, вчені, які використовують зонд LASSO, можуть захопити тисячі послідовностей за одну спробу.
Зображення: Дженніфер Е. Ферман / Університет Джона Хопкінса
«Наша мета полягає в тому, щоб зробити будь-якого дешевого і легкого для будь-якого дослідника в будь-якій області клонувати і висловлювати весь набір білків з будь-якого організму», - сказав професор медичної школи Університету Джона Хопкінса, професор патології і дослідження, старший автор Бен Ларман в прес-релізы. «До сих пір така перспектива була реалістичною тільки для потужних дослідницьких консорціумів, які вивчають модельні організми, такі як плодові мушки або миші».
Високошвидкісні відкриття
Метод LASSO покращує молекулярні інверсійні зонди (MIPs), старіший метод, який обмежений захопленням тільки близько 200 баз ДНК відразу. Це мало в порівнянні з кожної послідовністю гена-мішеней LASSO, яка може становити до декількох тисяч пар основ ДНК протягом тривалого часу по відношенню до послідовності, що кодує білка типового гена.
Команда використовувала зонди LASSO для одночасного захоплення більше 3000 фрагментів ДНК з генома E. coli в рамках дослідження доказової концепції. Вони успішно захопили щонайменше 75 відсотків своїх генних об'єктів. Що ще більш важливо, однак, цей інструмент дозволяє дослідникам фіксувати послідовності таким чином, щоб вони могли аналізувати, що роблять відповідні білки.
«Ми дуже раді всім потенційним додатків для клонування LASSO», - сказав Ларман у випуску. «Ми сподіваємося, що завдяки значному збільшенню кількості білків, які можуть бути виражені і скрініровани паралельно, шлях до цікавої біології і новим терапевтичним біомолекул буде значно скорочений для багатьох дослідників».
Література: Newswise, Nature Biomedical Engineering
