Дослідники перетворюють КРІСПР в машину для знищення вірусів
На перший погляд, лихоманка Ебола і грип можуть здатися не такими вже схожими — один може викликати руйнування органу або смерть, в той час як інший зазвичай просто змушує вас відчувати себе по-справжньому млявим — але насправді у них одна і та ж причина: РНК вірус.
Цей тип вірусу стоїть за деякими з найбільш поширених і смертельно небезпечних хвороб у світі, і дослідники тільки що знайшли спосіб використовувати потужну технологію редагування генів CRISPR в боротьбі з ними.
У четвер команда, очолювана дослідниками з Гарвардського університету та Інституту широкомовлення Массачусетського технологічного інституту, опублікувала дослідження в журналі Molecular Cell, детально описує створення CARVER (Cas13-Assisted обмеження вірусної експресії і зчитування), системи, що використовує фермент CRISPR Cas13, який «природним чином націлюється на вірусну РНК в бактеріях», говориться в прес-релізі Інституту Броада.
Команда почала з аналізу вірусів на основі РНК, щоб знайти вірусні послідовності РНК, на які може націлюватися Cas13. Вони спеціально хотіли вирізати послідовності, які навряд чи могли викликати мутації, але могли б відключити вірус.
«Теоретично, ви можете запрограмувати Cas13 для атаки практично на будь-яку частину вірусу», — сказав дослідник Кемерон Мірволдом в прес-релізі. «Але існує величезна різноманітність всередині і між видами, і велика частина геному швидко змінюється в міру розвитку вірусу. Якщо ви не будете обережні, ви можете мати на меті, яка в кінцевому підсумку не матиме ніякого ефекту».
Дослідники протестували систему з використанням клітин людини, інфікованих трьома вірусами на основі РНК: вірусом лімфоцитарного хоріоменінгіту, вірусом грипу А і вірусом везикулярного стоматиту. Протягом 24 годин ферменти Cas13, які вони раніше вводили в клітини, знижують рівні вірусної РНК до 40 разів.
Потім вони об'єднали свою систему Cas13 з діагностичним інструментом SHERLOCK, щоб дати йому можливість вимірювати рівні вірусної РНК в зразку — і, таким чином, народилася система CARVER.
«Ми припускаємо, що Cas13 стане дослідним інструментом для вивчення багатьох аспектів вірусної біології в клітинах людини», — сказала дослідник Кетрін Фрейе в прес-релізі.
«Це також може бути клінічний інструмент, в якому ці системи можуть використовуватися для діагностики зразка, лікування вірусної інфекції та вимірювання ефективності лікування, — продовжила вона, — і все це завдяки здатності швидко адаптувати CARVER. боротися з новими або стійкими до ліків вірусами в міру їх появи ».
Джерела: Broad Institute
