Новий тест може знайти будь-яку бактерію, що викликає хворобу

Rocky Mountain Laboratories \ NIAID \ NIH

Дослідники розробили систему, яка використовує 4,2 мільйона генетичних зондів для виявлення сигнатурної ДНК всіх 307 видів патогенних бактерій.

Потужна платформа

Більше 300 типів бактерій можуть викликати захворювання у людей. Тепер у нас нарешті є спосіб показати їх всім відразу.

Сьогодні найпередовіші платформи для скринінгу бактерій можуть шукати тільки ознаки 19 типів бактерій в зразку. Тепер, дослідники з Колумбійського університету кажуть, що вони придумали нову систему, яка може відображати для всіх 307 типів, які, як відомо, одночасно викликають захворювання у людей - і це може виявитися потужним зброєю в глобальній боротьбі проти стійкості до антибіотиків.

Дослідження для підказок

В дослідженні, опублікованому у вівторок в журналі mBio, дослідники описують систему, яку вони називають BacCapSeq, яка, за їх твердженням, використовує 4,2 мільйона генетичних зондів для виявлення сигнатурної ДНК всіх 307 видів патогенних бактерій.

Кожен з цих зондів зв'язується з однією бактерією або биомаркером для стійкості до антибіотиків і вірулентності (здатність бактерій інфікувати господаря). Якщо ця бактерія або біомаркерів виявляється в зразку крові, зонд замикається на ній таким чином, що людина, що аналізує зразок, може виявити.

«Після того як він схвалений для клінічного застосування, BacCapSeq надасть лікарям потужний інструмент для швидкого і точного скринінгу всіх відомих патогенних бактерій, в тому числі тих, які викликають сепсис, третю провідну причину смерті в Сполучених Штатах», перший автор Orchid Allicock йдеться в прес-релізі. «Ця платформа в 1000 разів чутливіша, ніж традиційне неупереджене тестування, на рівні, порівнянному з тестами, які показують одну бактерію за раз».

Опір

Незважаючи на те, що він має безліч переваг в порівнянні з існуючими системами, BacCapSeq не так вже й краще з точки зору швидкості. Найпоширеніший тест на сепсис займає близько 72 годин, в той час як BacCapSeq потрібно 70 годин для отримання результатів.

Однак, тест на сепсис не має ознак стійкості до антибіотиків, і лікарі часто призначають антибіотики пацієнтам, перш ніж вони навіть отримають результати.

Команда Колумбійського університету думає, що зможе скоротити час, необхідний BacCapSeq для отримання результатів. Якщо вони будуть успішними, вони також можуть зменшити кількість людей, яким не потрібно призначати антибіотики, тим самим допомагаючи пом'якшити проблему надмірного застосування ліків, що лежить в основі кризи резистентності до антибіотиків.

Джерела: EurekAlert